Ở bậc sau đại học, Khoa Toán - Tin học chịu trách nhiệm quản lý chuyên môn, mỗi ngành có người phụ trách ngành là trưởng bộ môn tương ứng hoặc đại diện cấp khoa, cụ thể:
| Phụ trách chung | Trưởng Khoa GS, TS. Mai Hoàng Biên |
| Ngành Đại số | GS, TS. Mai Hoàng Biên |
| Ngành Toán Giải tích | PGS, TS. Lý Kim Hà |
| Ngành Toán ứng dụng | PGS,TS. Nguyễn Lê Hoàng Anh |
| Ngành Xác suất - Thống kê | GS, TS. Đặng Đức Trọng |
| Ngành Cơ sở toán học cho tin học | PGS, TS. Nguyễn Thanh Bình |
Các thủ tục hành chính được Phòng Đào tạo Sau Đại học của Trường quản lý. Học viên có thể tra cứu các thông báo quan trọng như thông tin tuyển sinh, quy chế đào tạo, lịch học, lịch thi trên trang web của Phòng Đào tạo Sau Đại học.
Ngoài ra, các thông tin về các học phần mới, seminar khoa học và các hoạt động chuyên môn sẽ thường xuyên được cập nhật trên trang web của Khoa Toán - Tin học, giúp học viên dễ dàng theo dõi và tham gia vào các hoạt động học thuật và nghiên cứu.
BẬC ĐÀO TẠO THẠC SĨ BẬC ĐÀO TẠO TIẾN SĨ
HỖ TRỢ TÀI CHÍNH VÀ CƠ HỘI HỌC TẬP
- Một số tổ chức có cấp học bổng cho người học sau đại học tại Khoa: Học bổng sau đại học của ĐHQG-HCM, Học bổng sau đại học trong nước của tập đoàn Vingroup
- Các ngành đào tạo Tiến sĩ của Khoa Toán - Tin học được tham gia Đề án 89 đào tạo giảng viên cho các trường đại học bằng kinh phí nhà nước.
- Một số học viên cao học và nghiên cứu sinh được hỗ trợ dưới dạng được kí hợp đồng làm trợ giảng hoặc làm giảng viên cho các môn học của Khoa. Học viên mong muốn tham gia giảng dạy có thể liên hệ người phụ trách ngành đào tạo của mình.
- Một số học viên cao học, nhiều nghiên cứu sinh được nhận tài trợ từ các đề tài nghiên cứu khoa học của giảng viên hướng dẫn.
- Các học viên cao học Toán Ứng dụng Pháp-Việt được tài trợ toàn phần chi phí và học phí sang Pháp làm luận văn trong 3 tháng.
